1926年陳煥鏞教授于中山大學任教，1927年4月20日到香港采集，同年創建了中山大學農林植物標本館。1954年12月由中山大學農林學院改隸中國科學院華南植物研究所，2003年10月因應中國科學院華南植物研究所更名，始用現名-----中國科學院華南植物園標本館。
    

    華南植物園標本館館藏熱帶亞熱帶植物標本達100萬份，其中有種子植物85萬份、苔蘚植物4萬份、蕨類植物4萬份、模式標本近7000份、復份標本10萬份，液浸標本6400份。尤其值得一提的是，本館收藏的東南亞國家（印度尼西亞、馬來西亞、菲律賓、越南、老撾、柬埔寨等國）的植物標本占本館標本的8％。特別有一批菲律賓標本，其本國標本已被毀于第二次世界大戰，而我館在抗日期間由于將標本轉移到香港得以保存完好。本館收藏最早的標本距今已有160多年的歷史。
       

    華南植物園標本館非常注重增加館藏量，除館內堅持派員到各地采集之外，也積極與全國各地和世界各地進行交換。在建館之初，陳煥鏞教授就與美國、英國、德國、法國等建立了正常的交換關系，現更擴展到60多個國家和地區。
       

    華南植物園標本館于建館之初就注重科學的管理方法，吸收了美國哈佛大學標本館以及世界先進的優秀標本館的管理體制，制訂了一套完善的管理方法，標本從科、屬、種、不同的國家和地區，有條不紊地進行分類管理。在過去無電腦管理的年代，建立了三套完善的卡片系統，可根據植物的名稱、采集人、標本號、地區分布等，從三套卡片系統中迅速查到所需的標本。在標本內還附有大量的原始記載、重要專著等文獻資料，為研究工作提供了有利的條件，并成為我館的二大特色。
      

    隨著科技的發展，為了更快捷方便的查閱館藏標本信息資料，華南植物園標本館于1999年率先在國內實施了標本數字化，并于最近完成了植物標本數據庫，與全國各大標本館合作，建立了一套數字標本館系統，把館藏標本全部數字化。這樣，在世界任何能上網的地方就可以查詢到本館的標本資料。
       

     華南植物園標本館的發展目標是創建一個世界水平的區域性標本館，宗旨是使館藏標本極富華南區域特色，使華南及東南亞地區植物標本科屬收集齊備，華南盡可能收齊到種，并集齊華南熱帶亞熱帶重要科屬的全世界標本。