三江源地區位于青海省南部，西南部與西藏自治區接壤，東部與四川省毗鄰，北部與青海省格爾木市、都蘭縣相接。三江源保護區的總面積為31.6萬多平方公里，占青海省土地總面積的32.7%。

三江源自然保護區是長江、黃河和瀾滄江的發源地，保護區有四個顯著特點：一是我國面積最大的自然保護區，保護區面積相當于兩個山東省的面積。二是我國海拔最高的天然濕地，平均海拔4000米左右，據科學家初步計算，長江總水量的25%、黃河總水量的49%和瀾滄江總水量的15%都來自三江源地區。三是世界高海拔地區生物多樣性最集中的地區，分布珍稀野生動物70余種。四是三江流域生態系統最敏感的地區，這一地區生態破壞將對三江流域內各省區經濟社會可持續發展帶來不良影響。

三江源自然保護區也包括了素有“黃河源頭姊妹湖”之稱的扎陵湖和扎陵湖，因此三江源自然保護區被譽為“中華水塔”。

游客一般從瑪多縣進入三江源自然保護區，從西寧乘班車前往瑪多縣，車程500多公里，需要10小時左右。從玉樹的結古鎮前往瑪多縣沒有班車，包車費用約300元，車程5小時左右。