玄奘寺為一仿唐式建筑，正方形的地磚散發著光滑與樸實感。寺內“國之環寶”匾額乃先總統蔣公親題，寺外大墻上，刻有玄奘西域游行圖與碑文三座；

左為日華親善紀念，中有大唐玄奘法師傳記，右則中日佛教親善交流紀念碑。此外，門前尚有兩尊石像，殿前有大鼓一座，登梯而上可見供人敲槌之醒鐘。

玄奘為唐朝高僧，受唐太宗之命前往印度取經，歷十余年返國，著經綸六百五十余部，與其弟子共譯75部，得1335卷，對佛教在中國的發展貢獻卓著。

中日戰爭期間，日人在南京掠走玄奘大師的靈骨，供奉在日本琦玉縣慈恩寺，公元1955年，始迎靈骨回國，供奉于日月潭畔之玄光寺，公元1965年11月，玄奘寺建成后，靈骨才遷迎入玄奘寺。

日月潭玄奘寺建于公元1965年，前臨拉魯島，后依青龍山，地理風水稱該寺占“青龍戲珠”寶地，廟分兩層，分別供奉玄奘舍利子與釋迦牟尼佛金身。