位于慈云寺大門左側的高山植物園建于一九一二年，46坪大的空間內展示有數百種植物，游客可經指示牌逐一辨識。

至于園旁的日式木造房屋即為高山博物館，館內陳列阿里山區常見之動物、植物、蝶類、土壤、礦物等標本與早期伐木、集材等器具模型，而鄒族吉老用具與照片等，亦可在此免費參觀。