該保護區內生活著許多瀕臨滅絕的高山珍貴動物，有野牦牛、藏羚羊、藏野驢等大型有蹄類動物，還有大量鳥類群集在各個高山湖泊中，數量不亞于青海湖。

這里的自然景觀也很優美，有世界上海撥最高的積沙灘沙漠、高原內陸不凍湖——阿其克湖、“高原桂林山水”新青峰、冰川密布的木孜塔格冰峰，此外還有千淚泉、陰陽湖、魔鬼谷等景點；在山中還發現了不少用藏文刻在石頭上的密宗咒語。

阿爾金山自然保護區位于若羌縣境內，在新藏交界的阿爾金山脈的中段，海拔約為4000米，面積約為4.5萬平方公里，它是我國最大的一個高山自然保護區。

由于保護區地理位置偏遠，道路條件欠佳，而且經常有野獸出沒，前往該地區旅游或考察，一定要經過當地政府的同意并取得必要的協助，經過周密安排和準備再出發。