三元宮是云臺山區的主廟，也是花果山的主體建筑。
三元宮易名海寧禪寺，早年供有三元圣像，現改塑釋迦牟尼佛。抗戰時期，三元宮龐大廟宇群化為一片瓦礫。近年經過多次修葺，已逐漸全面恢復原貌，只在東南部位的下方，保留下一塊當年的殘垣斷壁，作為歷史的見證。
三元宮的主要建筑－大雄寶殿，面前有兩棵千年銀杏，顯示著三元宮古老的歷史。抗日戰爭時三元宮遭受日寇飛機的狂轟濫炸，這兩棵樹雖然枝干斷裂遍體枯焦，但在勝利的春風吹拂下，又綻發新芽，結出了累累果實。
相關知識：三元信仰源遠流長，早在1600年多年前東晉時代，干寶的《搜神記》上便載有東海人陳光蕊，生了三個兒子，得道升仙。分管天、地、水三界的記敘。明代蘇北魯南三元信仰非常興旺，萬歷十五年（1587年）淮安人謝淳破家擴建三元宮，奠定了三元宮建筑群的基礎。
《西游記》的作者吳承恩更是三元的堅定信仰者，書中記載唐僧是東海陳光蕊的兒子，這廟里的三元也就是唐僧的骨肉兄弟。
1938年夏天，三元宮慘遭日寇飛機轟炸后，寺僧們聯絡山民共20余人奮起自衛，多次成功地伏擊了搜山的日寇。1939年農歷七月十四日早晨，日寇集中300余人，兵分四路圍剿三元宮及所屬寺廟，戳死仁芳法師，綁走德選等四位法師和六位山民，除放走一位山民外，其余全部活埋。幾天后，日寇又兩次前來控山，把三元宮及所屬的玉皇宮、九龍廟、屏竹社等13處廟宇全部放火焚燒，使這座海內知名的龐大廟宇群化為一片瓦礫。
交通可在連云港市中心新浦乘10路車，海州西門乘5路車到花果山，再步行或乘區內小巴（15元）到達。